Programming_by_biologist_ongoing https://blog.hatena.ne.jp/Programming_by_biologist_ongoing/ Programming_by_biologist_ongoing’s diary https://biologist-programming-training.hatenablog.com/ TCGAデータ解析 それでは、ここからはダウロードしたデータ ("tcga_RSEM_gene_tpm.gz")を使用して、ある癌腫のデータの抽出に進みたいと思いますが、今日はファイルの格納場所を設定し、ファイルを読み込む方法を記載したいと思います。 行動2 データを読み込み、構造を理解する。 2-1) データ格納フォルダをRに教える (ディレクトリの設定) 以前(R Studioの設定)にて右下にある"Environment,History~"の中で、"File"タブをクリックすると、現在defaultで選択されている作業ディレクトリが表示されます。TCGAデータが格納されている場合(もしくは、ファイルを表示デ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fbiologist-programming-training.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F09%2F05%2F004017" title="第1目標：TCGA dataの各癌腫ごとのTPMデータの取得 (行動2：ディレクトリの設定、packageのinstallと呼び出し、データの読み込みと構造の理解) - Programming_by_biologist_ongoing’s diary" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/P/Programming_by_biologist_ongoing/20230903/20230903225105.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-09-05 00:40:17 rich https://biologist-programming-training.hatenablog.com/entry/2023/09/05/004017 1.0 100%