choron81 https://blog.hatena.ne.jp/choron81/ いろいろ倉庫 https://choron81.hatenablog.com/ Python 化学的な ・お題：Pythonで共通構造を持つ低分子化合物を弄っていた。構造情報を分かりやすく示したい。 ・以下のサイトなどを参考にさせて頂いた。正しいことは元サイトをご確認いただきたい。 qiita.com ・まず、化合物の構造を落としてくる。今回はchemblから化合物を借りてきた（割愛）。検索した化合物はsdfでカレントディレクトリに保存した。 www.ebi.ac.uk ・次に、sdfファイルを読み込む。今回は、rdkitを用いて処理を進めていく。 from rdkit import Chemsuppl = Chem.SDMolSupplier("20230226.sdf", removeHs … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fchoron81.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F03%2F03%2F000000" title="【Python】共通構造をもつ化合物を分かりやすく示したい - いろいろ倉庫" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/c/choron81/20230227/20230227001132.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-03-03 00:00:00 rich https://choron81.hatenablog.com/entry/2023/03/03/000000 1.0 100%