elnikkis https://blog.hatena.ne.jp/elnikkis/ elnikkis’s diary https://elnikkis.hatenablog.jp/ makeで疲弊している人はSnakemakeを使うべき。Snakemakeは便利なワークフロー管理ツールです。 うちの大学には格安なクラスタがあります。Snakemakeは各タスクをクラスタのジョブとして実行する機能を持っているので、それを使ってTUTクラスタを使うための設定ファイルを公開しています。 github.com ほぼSnakemakeをpbsproで使うための設定ですが、一部TUTクラスタの仕様に合わせた設定にしてあります。以下の点を直せばたぶん他のpbspro環境でも使えます。 testディレクトリの中のpbs-jobscript.shの中でexport PATHがしてある（ジョ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Felnikkis.hatenablog.jp%2Fentry%2F2020%2F10%2F20%2F194252" title="SnakemakeでTUTクラスタを利用する方法 - elnikkis’s diary" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-10-20 19:42:52 rich https://elnikkis.hatenablog.jp/entry/2020/10/20/194252 1.0 100%