hacchy https://blog.hatena.ne.jp/hacchy/ Hacchy’ Blog https://hacchy.hatenadiary.org/ NGS SRA 久々に SRA からデータをダウンロードしようとしたら，ちょっとしたエラーが出てきた。正確には，ダウンロードのところではなく，sra-lite ファイルから fastq ファイルへ dump するところで。エラーメッセージは，こんな感じ。 fastq-dump -A SRR101400 -M 0 /Path/To/SRA/SRRXXXXXX.lite.sra 2011-05-02 11:19:11 fastq-dump WARNING: path not found while selecting metadata within database module - physical colum… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fhacchy.hatenadiary.org%2Fentry%2F20110502%2F1304340160" title=" fastq-dump.1.1.1 -&gt; fastq-dump.1.2.0 - Hacchy’ Blog" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2011-05-02 21:42:40 rich https://hacchy.hatenadiary.org/entry/20110502/1304340160 1.0 100%