biodata https://blog.hatena.ne.jp/biodata/ いろいろ試してみる https://imamachi-n.hatenablog.com/ NGS SRA NCBI GEO 次世代シーケンス 概要 NCBI GEOからまとめてSRAファイルを取得したい。 準備 Entrez Directのコンパイル済みのバイナリファイルをダウンロードして、パスを通すだけ。 * Entrez Direct ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/entrezdirect/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/news/02-06-2014-entrez-direct-released/ インストール例 $ wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/entrezdirect/edirect.tar.gz $ tar … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fimamachi-n.hatenablog.com%2Fentry%2F2017%2F01%2F14%2F220215" title="NCBI GEOからまとめてSRAファイルを取得する - いろいろ試してみる" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://img.esa.io/uploads/production/attachments/3909/2016/12/14/11755/bfa2af82-e493-4b2a-8f5e-fa69819c51e3.png Hatena Blog https://hatena.blog 2017-01-14 22:02:15 rich https://imamachi-n.hatenablog.com/entry/2017/01/14/220215 1.0 100%