Jugem https://blog.hatena.ne.jp/Jugem/ Bio-Station https://jugem.hatenadiary.jp/ ドライ解析のトラブルシューティング 今回は管理人が困ったトラブルの解決法 ~seqのマッピングで困ったことが起きた。 fastqをトリミングする前はちゃんとマッピングされる(bowtie)のに、トリミングするとなんだか下のようななエラーが出てしまうというもの。。 Saw ASCII character 10 but expected 33-based Phred qual. ググってみるとちゃんとダウンロードできているか？とか書いてあるが、トリミング前は問題なく走るのでそこではないだろう。で、色々調べていると、 トリミングで0bpのリードが出てきてしまうのが原因らしい。 そういうわけで cutadaptのオプション、-mで1bp… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fjugem.hatenadiary.jp%2Fentry%2Ffastq" title="エラー；Saw ASCII character 10 but expected 33-based Phred qual. - Bio-Station" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-03-01 17:58:46 rich https://jugem.hatenadiary.jp/entry/fastq 1.0 100%