k-kuro https://blog.hatena.ne.jp/k-kuro/ kuroの覚え書き https://k-kuro.hatenadiary.jp/ Science 結局のところNGSが出力したデータをきちんとマッピングから行わないとSNP検出どころではないという結論にいたり short readのマッピングからまじめに考えることになった。IonProtonの結果をまずはFASTQ形式で出力する。このファイルはシークエンサーが読んだshort readsの配列情報そのもの。CLC genetics workbenchでの解析 まずはFASTQファイルのインポートから。”Import”ボタンからメニューを出して”IonTorrent"を選択する。 optionはDiscard read nameは入れておいてもいいかも。ほかは外しておく。インポートされたファ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fk-kuro.hatenadiary.jp%2Fentry%2F20140610%2Fp1" title=" NGSデータ解析 - kuroの覚え書き" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2014-06-10 00:00:00 rich https://k-kuro.hatenadiary.jp/entry/20140610/p1 1.0 100%