kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ assembly Nanopore long read 高速なツール 2016 Bioinformatics assembly graph polish Overlap-layout-consensus (OLC) 2019 4/4 ヘルプ追記 2019 6/21 文章修正 2019 7/17 コメント追加 2019 7/26 追記 2019 10/14追記 2019 11/5 コマンドに-t <NUM> 追加の修正 2020 3/30 関連ツール追記 MiniasmはPacbioのロングリードやナノポアのロングリードのアセンブルツールで2015年に論文が発表された (ref.1)。アルゴリズムはオーバーラップ法になる。アセンブル時間が非常に短いのが特徴で、ナノポアリードのアセンブルの比較ペーパーでは、競合アセンブラが数時間かけるデータを２分で終えると書かれている(ref.2)。 インストール GitHu… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2017%2F06%2F18%2F161718" title="Oxford Nanoporeリードのアセンブリ MiniasmとNanopolish - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20170622/20170622221043.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2017-06-18 16:17:18 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2017/06/18/161718 1.0 100%