kazumaxneo
https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/
macでインフォマティクス
https://kazumaxneo.hatenablog.com/
RNA seq
RNAseqの定量
Bioconductor
normalize
2010
Bioinformatics
2019 4/30 インストール方法修正 2022 1/23 追記 発現が負の二項分布に従うと仮定した検定法。正規化はTMMで行う。FPKM/RPKM補正のcufflinksより正しくDEGの検出ができる検定法とされる。詳細は門多先生のスライドやdry本の序章の正規化の話を読んでください。以下のマニュアルも大変参考になります。後半で正規化法について詳しく書かれています（英語です）。 http://chagall.med.cornell.edu/RNASEQcourse/Intro2RNAseq.pdf こちらはTMM正規化の流れが丁寧に書かれています。 http://www.nathaliev…
190
<iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2017%2F07%2F11%2F114021" title="edgeR - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe>
https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20170710/20170710110348.jpg
Hatena Blog
https://hatena.blog
2017-07-11 11:40:21
edgeR
rich
https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2017/07/11/114021
1.0
100%