kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ trimming / preprocessing fasta/fastqの操作 2017 BMC Bioinformatics AfterQCはfastqのフィルタリング、トリミング、エラー修復、およびクオリティチェックを全て自動で行なってくれるツールである。エラー修復はオーバーラップするペアードエンドリードのクオリティを比較して実行される。2017年に論文が発表された。 インストール Github git clone https://github.com/OpenGene/AfterQC.git $ after.py -h Usage: Automatic Filtering, Trimming, Error Removing and Quality Control for Illumina fastq data S… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2017%2F09%2F17%2F004000" title="QC、エラー修復、トリミング、レポート作成を自動実行する AfterQC - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20170917/20170917002342.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2017-09-17 00:40:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2017/09/17/004000 1.0 100%