kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ assembly NGS解析の基礎知識 Pacbio Nucleic Acids Research 2016 large genome hybrid assembly 2021 6/17 condaインストール追記 quickmergeは、ロングリード情報を使い、アセンブルのcontiguityを向上させるツール。特にロングリードのカバレッジがmodestな時にcontiguityが大きく向上するとされる。他のツールのアセンブル結果を入力ファイルとする。 インストール Github https://github.com/mahulchak/quickmerge git clone https://github.com/mahulchak/quickmerge.gitcd quickmergebash make_merger.sh#condaconda ins… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2017%2F10%2F26%2F010151" title="ハイブリッドアセンブルを行うquickmerge - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2017-10-26 01:01:51 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2017/10/26/010151 1.0 100%