kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ GUIツール 結果の視覚化 (visualization) ゲノム比較 (comparative genomics) human genome synteny_block 2007 BMC Bioinformatics Cintenyは類似の生物間のゲノム配列を比較し、Synteny block（wiki）で描画するツール。人やマウスなどのデータについてはビルド済みのwebサーバーが提供されており、すぐにゲノム比較を行うことができる。 webサーバー http://cinteny.cchmc.org 使い方についてのデモ動画。 http://cinteny.cchmc.org/doc/demo.php 人とチンパンジーのゲノムを選択しstartをクリック。 whole genome analysis のsubmitをクリック。 上がヒトゲノム、下がチンバンジーゲノム。色が残っている領域が２生物間で類似している… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F01%2F12%2F014644" title="Synteny blockを検出して、染色体の類似領域を可視化する Cinteny - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20180112/20180112012420.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2018-01-12 01:46:44 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/01/12/014644 1.0 100%