kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ RNA seq annotation 2015 Nucleic Acids Research coding region GeneMarkS-T は教師なし学習でトレーニングされたRNAのタンパク質コード領域を予測ツール。原核生物向けのGeneMarkSを真核生物向けに拡張して作られた。データサイズに寄らず一定の検出率を示すため、データが莫大になるメタトランスクリプトーム解析のコード領域予測にも向いているとされる。 ダウンロード このリンクからlinux64bit版をダウンロードできる。 GeneMark™ download > perl gmst.pl $ perl gmst gmst_linux_64.tar gmst.pl [uesaka@cyano GeneMarkS-T]$ perl gmst.pl G… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F01%2F30%2F203613" title="真核生物のRNAのコード領域を予測するGeneMarkS-T - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-01-30 20:36:13 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/01/30/203613 1.0 100%