kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ k-mer アセンブル、リピート検出、エラー検出などNGSの多くの方法論においてk-merカウンタが使用されている。大規模なデータのk-mersを数えるには、非常に高速で効率的なアルゴリズムが必要となる。KCMBTは、このk-merカウント問題のためのアルゴリズム。KMC2より約30％、Jellyfish2より約6倍高速に動作するとされる。 インストール Github GitHub - abdullah009/kcmbt_mt: k-mer Counter based on Multiple Burst Trees (multi-threaded) git clone https://github.com… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F02%2F20%2F012122" title="k-merを高速にカウントする KCMBT - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-02-20 01:21:22 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/02/20/012122 1.0 100%