kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ assembly Nanopore long read イルミナのようなハイスループットシーケンシング技術は、リード長は犠牲になるがシーケンシングコストは大幅に減らすことができる。しかし、ゲノムにはリピート配列が含まれているため、デノボアセンブリで問題になる。PacBioのSMRTやOxford Nanopore Technology（ONT）などの最近のロングリードシーケンシング技術は、10 kb以上の長さのリード（論文より Koren and Phillippy、2015）を生み出すため、デノボアセンブリのルネサンスを促した。しかし、高いエラー率（〜15％）は、アセンブリ作業を困難にし、複雑かつ計算集約的なパイプラインを必要とする。ロングリード… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F03%2F28%2F235007" title="ONTリードのレイアウトを計算しコンセンサス配列を出力する spectrassembler - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-03-28 23:50:07 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/03/28/235007 1.0 100%