kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ mapping color space 次世代シークエンシング（NGS）技術の出現と急速な進歩により、ショートリードアラインメントアルゴリズムの開発には相当量の研究努力が払われてきた。様々なショートリードアライナーが開発されており、機能性の点でさらに2つの世代に分類することができる。第1世代アライナーは、通常、非常に短いリード（通常100 bps以下）で設計され最適化されている。これらのアライナーは、通常、リードがゲノムからの非常に小さな偏差を有すると仮定し、したがって典型的にはミスマッチのみを許容する。いくつかのアライナーがギャップをサポートしているにもかかわらず、ギャップの最大許容数は速度のためにかなり制限されている（通常は1つ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F03%2F31%2F103447" title="color spaceのアライナー CUSHAW3 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-03-31 10:34:47 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/03/31/103447 1.0 100%