kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ ゲノム比較 (comparative genomics) 高速なツール 結果の視覚化 (visualization) workflow SNV repetitive sequences 2018 dot plot genome alignment 2018 9/1-9/6 アライメントワークフロー 2018 11/25 誤字修正 2019 6/9 show-tiling help追加 2019 6/12 dot plot表追加 2019 8/5 インストール追記 2019 11/12 bioconda link追加 MUMmer3 シーケンスアライメントパッケージ[mummer4論文より ref.1]の2004年のpublish以来、バイオインフォマティクスのランドスケープは劇的に変化した。シーケンスデータを生成するコストは急速に低下し、組み立てられたゲノムの数が急激に増加し、配列決定に基づくアッセイが急増した。これらの増加に伴い、効率… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F04%2F21%2F165855" title="ゲノムを比較する MUMmer - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20180421/20180421153036.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2018-04-21 16:58:55 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/04/21/165855 1.0 100%