kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ VCF bam/sam structural variations (SV) 結果の視覚化 (visualization) repetitive sequences evaluation tool 2020 Preprint 2021 Genome Biology 2020 9/26 Preprint引用、condaによるインストールコマンド、help追記 2021 5/27 論文追記 構造変異（SV）検出において、視覚的な検証は偽陽性を排除するために不可欠なステップである。著者らは、ショートリード、ロングリード、フェーズドリードを含む、複数のサンプルやシーケンス技術にまたがるSVを判定するために必要なリードのデプスと配列のアラインメントを表示するイメージを迅速に作成するためのツールであるSamplotを紹介する。これらのシンプルなイメージは、大規模なSVコールセットをキュレーションするための迅速なレビューに役立つ。Samplotは、疾患研究における原因… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F04%2F28%2F182216" title="構造多型部位のマッピング状況を出力する samplot - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20180428/20180428160020.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2018-04-28 18:22:16 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/04/28/182216 1.0 100%