kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 生物種の推定 (taxonomic profiling) 結果の視覚化 (visualization) リアルタイム解析 metagenome ゲノムシーケンシングデータのリアルタイム解析は、シーケンサがまだ稼動している間にデータを分析できるため、過去数年にわたって特に注目を集めている。しかし、Minionシーケンサーをベースにしたライブ解析アプローチの可能性は、これらのデバイスのスループット・レートとシーケンスクオリティが低いため、依然として限られている。 著者らは、HiLive（Lindner et al 2017）を用いて、イルミナのシーケンサーからのハイスループットシーケンシングデータのリアルタイム解析のための最初の方法を提案し、新しい分野のアプリケーションを可能にした。メタゲノム研究の場合、Kraken（Wood and S… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F06%2F11%2F122637" title="メタゲノムのリアルタイム分類ツール LiveKraken - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-06-11 12:26:37 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/06/11/122637 1.0 100%