kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ fasta/fastqの操作 bam/sam 結果の視覚化 (visualization) fastqpはシンプルなNGSのシーケンスデータ（fastq、sam、bam）評価ツール。 インストール mac os 10.13 python2.7.14環境に導入した。 依存 Tested on Python 2.7, and 3.4 Tested on Mac OS 10.10 and Linux 2.6.18 Numpy, Scipy, and Matplotlib samtools 本体 Github https://github.com/mdshw5/fastqp Matt ShirleyさんはBiostarsでも度々返信されていますね。 pipで導入できます。 pip insta… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F06%2F22%2F091746" title="シンプルなfastq、sam、bamの分析ツール fastqp　 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20180622/20180622090028.png Hatena Blog https://hatena.blog 2018-06-22 09:17:46 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/06/22/091746 1.0 100%