kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ fasta/fastqの操作 SeqstatsはHeng Li（wiki）の優れたklibライブラリを使い、Cで書かれたツール。 シーケンスリード、リファレンスゲノムおよびアセンブリファイルの一般的な要約統計情報を提供する。 gzipまたはプレーンのfastqおよびfastaファイルを読み込むことができる。 インストール Github git clone --recursive https://github.com/clwgg/seqstats cd seqstats make > ./seqstats $ ./seqstats Usage: ./seqstats <in.fasta|in.fastq> ラン シングルエン… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F06%2F24%2F235942" title="fasta、fastqの簡単なstatisticsを出す Seqstats - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-06-24 23:59:42 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/06/24/235942 1.0 100%