kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2017 Nature Biotechnology 高速なツール protein search metagenome sequence clustering 2019 3/18 タイトル修正、 5/7 タイトル修正、5/20 インストール追記、 8/25 twtwitter追記、12/29, 2021 9/15インストール追記 2024/11/14 GPU追記 DNAシーケンシングのスループットは、過去10年間で計算速度よりもはるかに速くなってきており、感度の高いシーケンス検索は、ラージメタゲノムデータセットの分析における主要なボトルネックになっている。それゆえ、著者らは、速度と感度のトレードオフの全レンジににわたって現在の検索ツールを改良し、400以上の倍の速度で、PSI-BLASTよりも良好な感度を達成し400倍以上高速なMMseqs2を開発し… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F09%2F22%2F220752" title="高速かつ高感度なプロテイン検索ツール MMseqs2 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20180922/20180922182940.png Hatena Blog https://hatena.blog 2018-09-22 22:07:52 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/09/22/220752 1.0 100%