kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 BMC Bioinformatics DNA motif ChIP-Seq transcription factor binding site sequence enrichment 一連のDNA配列が与えられた場合、モチーフ発見は、偶然によって予想されるよりも配列中で有意に頻繁なover-represented（以後、過剰表現）されたモチーフを見つけることにある。これは、バイオインフォマティクスと同程度の歴史を持ち、多数のアプリケーションを持つ古典的なタスクである。このアプローチの背後にある根本的な前提は、過剰表現されたモチーフが生物学的機能を示すか、または何らかの現象を説明することである。モチーフ発見は、調節領域を分析し、共調節遺伝子のプロモーター配列中の転写因子結合部位（TFBS）を検出するために、またはChIP-seq実験のピーク領域でエンリッチされているモチーフを… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F10%2F20%2F073000" title="エンリッチされたDNAモチーフ配列を検出する DiNAMO - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-10-20 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/10/20/073000 1.0 100%