kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 Bioinformatics contigのscaffolding 結果の視覚化 (visualization) assembly GUIツール RNA seq evaluation tool assembly graph 2018 11/27 誤字修正 Scaffoldingはすべてのゲノムアセンブリパイプラインの重要なステップである。scaffoldingにより、メイトペアライブラリやロングリードなどのさまざまなタイプのリンケージ情報を使用してコンティグをより長い配列にアラインできる。 ここでは Scaffold Graph ToolKit（SGTK）と呼ばれるソフトウェアパッケージを提供する。このソフトウェアパッケージは、さまざまな種類のシーケンシングデータを使用してscaffold graphを構築し、視覚化することを可能にする。Scaffold graphは、ゲノムアセンブリの分析と評価に役立つ。 イン… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2018%2F11%2F27%2F073000" title="アセンブリのグラフを可視化し、アセンブリの評価・分析を助ける SGTK - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20181124/20181124125158.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2018-11-27 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2018/11/27/073000 1.0 100%