kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 Preprint Nanopore long read assembly automatic pipeline Bioinformatics evaluation tool benchmark polish ナノポアシークエンシングは、エラーが発生しやすいクオリティが一貫したロングリードを生成する第3世代のシークエンシング方法である。簡単に言うと、DNAまたはRNA鎖がタンパク質の細孔を通って引っ張られ、細孔を介して電気抵抗に影響を与えこれが記録される。Base callers、すなわち塩基の特定の組み合わせについての電流レベルに関する経験的に得られた情報を使用するソフトウェアツールは、その後、経時的に電流を核酸配列に翻訳する。 ナノポアシーケンシングは、オックスフォードナノポアテクノロジーズ（ONT）による手持ちできるMinIONシーケンサーの導入により、商業的には2014年に登場した。 2つの… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F01%2F15%2F073000_1" title="ONTのロングリードを自動でアセンブリして公開し、比較できるツール poreTally - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20190113/20190113162656.png Hatena Blog https://hatena.blog 2019-01-15 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/01/15/073000_1 1.0 100%