kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2010 Journal of Microbiological Methods rRNA fasta/fastqの操作 family trios V-Xtractorは、隠れマルコフモデルを使用して、16S/18S rRNAの定義済みの超可変配列セグメント（V1〜V9）を検索、検証、および抽出する。99.6％の検出効率と低い偽陽性感受性により、このツールはデータの信頼性を向上させ、その後のコミュニティアッセイでの分析を容易にする。 インストール ubuntu16.04でテストした。 依存 Perl HMMER version 3 (note: V-Xtractor 2.0 requires HMMER version 3. An older version of V-Xtractor running on HMMER version 2… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F01%2F29%2F073000" title="16S/18S rRNAのV1~V9領域の配列を取り出す V-Xtractor - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2019-01-29 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/01/29/073000 1.0 100%