kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ mapping Pacbio Smith-Waterman / Needleman–Wunsch 2019 5/30 インストール追記 InDelFixerは454、Illumina、およびPacBioデータ用の高感度なアライナーである。完全なSmith-Watermanアライメントを採用している。事前の高速k-merマッチングによって次世代シーケンス（NGS）および第3世代のリードを一連のリファレンスシーケンスにアライメントする。 インストール mac os10.14のjava1.8環境でjarファイルをダウンロードしてテストした。 Github リリースから.jarファイルをダウンロードする。condaでも導入できる。 #bioconda (link)conda install -c … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F05%2F10%2F073000" title="Illumina、454、およびPacBioのSmith-Watermanアライメントによる高感度なアライナー InDelFixer - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2019-05-10 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/05/10/073000 1.0 100%