kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2016 Bioinformatics evaluation tool assembly metagenome 結果の視覚化 (visualization) download Nanopore long read Pacbio 2019 5/27 追記 2021 6/15, 6/22 コマンド修正 メタゲノミクスは、環境サンプルから直接採取した遺伝物質を研究する。 NGS技術は、クローニングなしに少量の生物からDNAを抽出しショートリードシーケンシングすることを可能にする。しかし、そのような実験で作成されたデータは膨大でノイズが多く、そして豊富さと相同性が大きく異なる何千もの種からのDNA断片を含む傾向がある。これらの課題は、メタゲノムアセンブリの新たな計算上の問題をもたらし、それに続いて標準的なベンチマーク手順を必要とする（Boisvert et al、2012； Peng et al、2012； Haider e… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F05%2F19%2F073000" title="メタゲノムアセンブリを評価する MetaQUAST - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2019-05-19 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/05/19/073000 1.0 100%