kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ taxonomy ID taxonomic assignment 生物種の推定 (taxonomic profiling) British Ecological Society 2018 metagenome Binning (metagenomics) LCA 2019 7/13 説明修正 2019 8/1 説明追記 2020 1/21 インストール手順修正 2020 2/4 データベースダウンロード手順修正 2020 4/17 コマンド修正 2020 4/19 binned fastaを使う手順追記 DNAシーケンシング、例えばアンプリコン、メタゲノムおよび全ゲノムシーケンシングは、微生物学および生態学から医学まで、ライフサイエンスの多くの分野において標準的な手順となっている。これらのシークエンシングプロジェクトの大部分における重要なステップは、例えば全ゲノムシークエンシング（WGS）プロジェクトにおける培養汚染を同定するため、またはメタゲノムアセ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F07%2F13%2F073000" title="シングルの配列やメタゲノムのbinned.fastaのtaxonomic classificationを行う BASTA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20190708/20190708202756.png Hatena Blog https://hatena.blog 2019-07-13 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/07/13/073000 1.0 100%