kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Preprint filtering contamination assembly graph assembly Nanopore long read Pacbio 2020 Bioinformatics 2020 4/23 論文追記 以前、ロングリードのアセンブリ前処理ツール yacrdを紹介した。 今回はアセンブリ過程でフィルタリングして出力を調節するfpaを紹介する。 以下のフィルタリングが行える (Githubより)。 internal match containment dovetails self matching read name match against regex length of overlap length of read in overlap Pierre MarijonさんのBlog (More details and some experiment are pr… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F07%2F18%2F073000" title="アセンブリ過程でロングリードをフィルタリングする fpa - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2019-07-18 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/07/18/073000 1.0 100%