kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Preprint plasmid assembly assembly graph metagenome 2021 Microbiome (Journal) 2021 6/27 論文引用 メタゲノムシーケンスは、多くの新しい細菌ゲノムシーケンスの識別とアセンブリをもたらした。 これらのバクテリアはしばしばプラスミドを含んでおり、それはあまり研究も理解もされていない。 これらのプラスミドの研究を支援するために、SCAPP（Sequence Contents Aware Plasmid Peeler）-メタゲノムシーケンシングからプラスミド配列をアセンブリするツールを開発した。SCAPPは、プラスミドアセンブリアルゴリズムのRecyclerのアイデアに基づいて構築され、プラスミドに関する生物学的知識を統合することでプラスミドアセンブリを改善する。 シミ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F02%2F24%2F073000" title="（メタゲノムの）アセンブリグラフから環状plasmid配列を出力する SCAPP - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-02-24 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/02/24/073000 1.0 100%