kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Nature Scientific Reports 結果の視覚化 (visualization) VCF テスト失敗 human genome Julia 次世代シーケンシングにより、膨大な量のゲノムデータが生成される。ゲノム情報の量は、研究によって異なる。バリアント検出プロセスでは、さまざまな種類のファイル形式が生成される。シーケンス解析で一般的に使用されるファイル形式の1つは、バリアントコールフォーマット（VCF）である。これは、バリアントコールプロセスで生成されるテキストファイル形式で、ゲノム内のバリアントの位置に関する情報が含まれている。この構造には、各ゲノム位置のサンプルの遺伝子型やリードデプスデータなどのバリアント情報が含まれる。リードデプスは、各患者の各バリアント位置でのシーケンスカバレッジの測定値である。VCFファイルには、メタ情… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F04%2F21%2F073000" title="バリアントコールのVCFを可視化する VIVA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-04-21 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/04/21/073000 1.0 100%