kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2016 Nucleic Acids Research web tool 系統解析 分子系統樹 phylogenetic tree Inference IQ-TREEはTREE-PUZZLEの後継プログラムであり、大規模な系統樹データの最尤解析を行うための効率的で汎用性の高い系統樹ソフトウェアである。IQ-TREEは効率的にツリー空間を探索し、RAxMLやPhyMLよりも高い尤度を達成することが多い。IQ-TREEの他の重要な特徴は、(i)分割スキームの発見を含む非常に高速なモデル選択手順、(ii)系統図データの分割解析、(iii)超高速ブートストラップ近似、(iv)いくつかの分岐検定と(v)ツリーのトポロジー検定(例: (ref.9)など)の実装である。 ほとんどの系統樹ソフトウェアパッケージ（IQ-TREEを含む）は、コマンドラインベース… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F06%2F07%2F235834" title="IQ-TREE をwebで使える W-IQ-TREE - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20200607/20200607184322.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-06-07 23:58:34 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/06/07/235834 1.0 100%