kazumaxneo
https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/
macでインフォマティクス
https://kazumaxneo.hatenablog.com/
2020
PNAS
Long Terminal Repeat retrotransposons (LTR-RTs)
transposon
repetitive sequences
large genome
2020 7/5 ProcessRepeatsのhelp追加 2020 7/6 step3修正 2020 7/7 ProcessRepeatsのコマンドの間違いを修正 2022/04/18 追記 2023/07/24 追記 Tree of life全体のゲノム配列決定のペースが加速しているため、 transposable elements（TE）のようなゲノム構成要素の教師なしアノテーションを改善する必要性が高まっている。TEの種類や配列は種によって大きく異なるため、自動化されたTEの発見とアノテーションは困難で時間のかかる作業となっている。重要な最初のステップは、ゲノム上に散在しているすべて…
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Hatena Blog
https://hatena.blog
2020-07-03 07:30:00
De novoでTEを探索する RepeatModeler2
rich
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