kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Preprint assembly misassembly 高品質のゲノムアセンブリは、遺伝学や医学研究の分野で幅広く応用されている。しかし、現在のワークフローでは、ギャップのない染色体スケールのアセンブリを実現することは非常に困難である。ここでは、preliminaryなアセンブリやキメラを含む生データからミスアセンブリを識別し、染色体スケールのリンケージグループにデータを分割する多層コンピュータグラフを用いた、chromosome-by-chromosomeなアセンブリ戦略を提案する。各リンケージグループの後続の独立したアセンブリは、通常、既存のワークフローを悩ませるミスアセンブリエラーから解放されたギャップフリーアセンブリを生成する。この柔軟なフ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F08%2F13%2F073000" title="複数のロングリードドラフトアセンブリを使って連続性の高いアセンブリを得る GALA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-08-13 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/08/13/073000 1.0 100%