kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Bioinformatics trimming / preprocessing 高速なツール windowsツール 2020 8/19 追記 現代のシーケンシング技術は、生物学や医学の多くの分野で革命を起こし続けている。生成されたデータセットはエラーが発生しやすいため、下流のアプリケーションでは通常、FASTQファイルを前処理するための品質管理手法が必要となる。しかし、このタスクのための既存のツールは、現在のところ、計算プラットフォームの機能を十分に活用できず、実行時間が遅くなっている。 ここでは、最新のハードウェアをフルに活用できるFASTQファイル用の非常に高速な統合品質管理ツールであるRabbitQCを紹介する。このツールには様々な操作が含まれており、様々なシーケンス技術（Illumina、Oxfor… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F08%2F19%2F060000" title="ショートリードとロングリード両方に対応した高速なクオリティフィルタリングツール RabbitQC - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20200819/20200819193150.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-08-19 06:00:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/08/19/060000 1.0 100%