kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ benchmark tips 2020 9/17、9/20 文章修正 3990x（64コア）のような多くのCPUコアが利用できるプロセッサを積んだ計算機を使いこなすには、高度に並列化された計算が欠かせない。しかし並列化は技術的に可能なケースと不可能なケースが存在する。並列化が捗りそうなHigh-Throughput Sequencing（HTS）関連の計算分野でも、CPUコア数増加に比例してほぼ線形の時間短縮が可能なタスクというものは少ない（*1）。しかしながら、１つのジョブでそれなりの計算時間を要するHTSの計算では、１つのジョブを走らせている間に別の処理を行うことも多い（*2）。そのため、利用可能なCPU数に余裕がある… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F09%2F17%2F235501" title="3990xの計算機でprokka を並列ランする(ベンチマーク) - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20200913/20200913154442.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-09-17 23:55:01 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/09/17/235501 1.0 100%