kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ metagenome サンプル中の微生物の存在と相対的な存在量を予測するメタゲノムプロファイリングは、マイクロバイオーム解析の重要な第一歩である。アラインメントベースのアプローチは、多くの場合、正確ではあるが計算が困難であると考えられている。ここでは、効率的かつ正確なアラインメントベースのメタゲノムプロファイリングを行う新しい手法、Metalignを紹介する。著者らは、新しい封じ込めミニハッシュアプローチを使用して、アライメントの前に参照データベースを事前にフィルタリングし、一意にアライメントされたリードとマルチアライメントされたリードの両方を処理して、正確なアバンダンス推定値を生成する。実際のデータセットとシミュ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F09%2F19%2F233000" title="Metalign - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-09-19 23:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/09/19/233000 1.0 100%