kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Preprint de novo transcriptome web tool automated pipeline taxonomic assignment annotation 2021 Nucleic Acids Research 2021 10/1 論文引用 ハイスループットシーケンシングの進歩は、RNA-Seqトランスクリプトームデータの膨大な増加をもたらした。しかし、特定の組織、状態、単細胞生物、微生物群集での迅速な遺伝子発現プロファイリングが期待されているが、新たな計算上の課題もある。リファレンスゲノムの利用可能性が限られているため、de novo アセンブル（メタ）トランスクリプトームは、これまでに明らかにされていなかった生物の遺伝子レパートリーを調べるための一般的なツールとして浮上してきた。しかし、その可能性にもかかわらず、これらのデータセットには断片的な配列や汚染された配列が含まれていることが多く、その解析… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F10%2F25%2F144028" title="de novo transcriptomeの系統解析と機能解析を行うwebツール TRAPID 2.0 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20201025/20201025135519.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-10-25 14:40:28 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/10/25/144028 1.0 100%