kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 Nucleic Acids Research repetitive sequences evaluation tool assembly plant 2020 11/7 タイトル修正 2020 11/8 感想追加 2020 11/11 誤字修正, タイトル修正（”主に植物”を削除） 構造的特徴に基づくコンピュータプログラムを用いたLTR要素の同定は効率的であるが(10,11)、多数の偽陽性(4)に悩まされている。最近、インタクトなLTRレトロトランスポゾンの正確なde novo同定のために、LTR_retrieverソフトウェアが開発された(4)。このツールは、入力品質に関係なく LTR の偽陽性を排除し、非常に低い偽発見率で超高感度・高精度を実証している(4)。植物ゲノムからインタクトな LTR 要素を検索している間に、ドラフトゲノムと比… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F11%2F07%2F165013" title="LTRレトロトランスポゾンを識別可能な割合でゲノムアセンブリを評価するIndex LAI - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20201107/20201107163854.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-11-07 16:50:13 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/11/07/165013 1.0 100%