kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ ゲノム比較 (comparative genomics) 結果の視覚化 (visualization) synteny_block gene cluster 2021 2020 Preprint Bioinformatics 2020 11/8 誤字修正、11/10 preprint引用追加、12/15 追記 2021 1/19 論文引用、11/8 ヘルプ更新 2022/11/24 コメント追記 2023/03/31 追記 生物学的パスウェイに関与する遺伝子は、多くの場合、遺伝子クラスターに集まっており、それらを比較することで、その機能や進化の歴史についての貴重な洞察を得ることができる。しかし、遺伝子クラスターの相同性の比較と可視化は、特に多くのクラスターを比較する場合には面倒な作業である。ここでは、Pythonベースのツールであるclinkerと、それに付随するJavaScriptビジュアライゼーションライブラリ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F11%2F08%2F004822" title="遺伝子クラスターを比較してインタラクティブな図で視覚化する clinker（clustermap.js含む） - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20201108/20201108002408.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-11-08 00:48:22 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/11/08/004822 1.0 100%