kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Bioinformatics Viruses assembly quasispecies ウイルスは、遺伝的に関連のある突然変異株のコレクションであるquasispeciesとして宿主に寄生する。Viral quasispeciesのアセンブリは、リードデータから株固有のハプロタイプを再構築することであり、株間の相対的な存在量を予測することは、治療に関連した様々な理由から重要なステップとなる。リファレンスゲノムに依存しない（「de novo」）アプローチは、リファレンスガイド型アプローチに比べて利点があるが、これは発散している株を扱う場合、リファレンスに起因するバイアスが圧倒的に大きくなるからである。現存するDe novo法は非常に正確ではあるが、コンティグが短いものしか得られない… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F11%2F16%2F234137" title="Viral quasispeciesのアセンブリを行う virus-vg - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2020-11-16 23:41:37 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/11/16/234137 1.0 100%