kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 Microbial Genomics MLST 結果の視覚化 (visualization) ゲノム比較 (comparative genomics) 細菌ゲノム疫学やアウトブレイク検出において、遺伝子ごとのアプローチがますます普及してきている。しかし、これらの方法論のためのスキーマ定義や対立遺伝子呼び出しのためのオープンソースのスケーラブルなソフトウェアが不足している。chewBBACAスイートは、新規の全ゲノムまたはコアゲノムの遺伝子ごとのタイピングスキーマの作成と評価、および関心のある細菌株におけるその後のアレルコールを支援するために設計されている。chewBBACAソフトウェアはPython 3.4以上を使用しており、ラップトップや高性能クラスタで動作するため、小規模な研究室から大規模なリファレンスセンターまで幅広く利用できる。Che… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2020%2F11%2F29%2F183949" title="ユーザー提供のゲノムfastaからwgMLSTおよびcgMLST解析 を行う chewBBACA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20201129/20201129181828.png Hatena Blog https://hatena.blog 2020-11-29 18:39:49 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2020/11/29/183949 1.0 100%