kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Bioinformatics Nanopore long read Long Terminal Repeat retrotransposons (LTR-RTs) 1000 ntを超える長いタンデムリピート拡張は疾患との関連性が示唆されているが、シークエンシンリード長が短すぎるため、ほとんどの場合、個々のヒトゲノムでは未解明のままである。しかし、新しいロングリードシークエンシング技術は、このようなリピート拡張にまたがる10,000nt以上のシングルリードを作成することができるが、これらのロングリードのエラー率は10％～20％と高く、リピートエレメントの検出を複雑にしている。さらに、タンデムリピートを見つけるための従来のアルゴリズムのほとんどは、短いタンデムリピート（1000nt未満）を見つけるために設計されており、ロングリードの高いエラー率を合理的な時間… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F01%2F27%2F073000" title="シークエンシングエラーの多いロングリードからLong Tandem Repeatsを探す mTR - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-01-27 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/01/27/073000 1.0 100%