kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ EM algorithm Alternative splicing RNAseqの定量 RNA seq 2020 Preprint 2021 1/28 カテゴリ追加、タイトル修正 ロングリードRNAシーケンシング（RNA-seq）技術により、転写産物全長の配列決定が可能となり、従来のショートリードRNA-seqよりもアイソフォーム特異的な遺伝子発現の探索が容易になった。しかし、ロングリードRNA-seqは塩基あたりのエラー率が高いこと、キメラリードやオルタナティブアラインメントの存在、その他のバイアスなどの問題があり、ショートリードRNA-seqとは異なる解析方法が必要とされていた。ここでは、ロングリードRNA-seqデータを用いてアイソフォームの発現を定量化し、Differentialなオルタナティブスプライシング（DA… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F01%2F28%2F073000" title="ロングリードRNA seqの転写産物レベルのリードカウントとスプライシングアイソフォーム検出を行う LIQA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-01-28 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/01/28/073000 1.0 100%