kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2020 Binning (metagenomics) metagenome メタゲノムシークエンシングは、微生物群集の構造、多様性、生態を純粋な培養物を得ることなく研究することを可能にする。多くのメタゲノム研究では、メタゲノムシークエンシングから得られたリードは、最初に長いコンティグにアセンブリされ、これらのコンティグは、クラスタ内のコンティグが同じ種に由来すると予想されるコンティグのクラスタにビン分けされる。異なる種がゲノム中で共通の配列を共有している場合があるため、1つのコンティグが複数の種に属している可能性がある。しかし、既存のツールでは、コンティグのビン分けは非オーバーラップビン分けしかサポートしておらず、各コンティグは最大で1つのビン（種）に割り当てられてい… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F02%2F07%2F111150" title="アセンブリグラフを用いたメタゲノムコンティグのビニングを行う GraphBin2 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-02-07 11:11:50 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/02/07/111150 1.0 100%