kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ metagenome Pacbio assembly assembly graph 2021 Preprint 2021 10/19 プレプリント引用 2023/07/06 追記 現在のメタゲノムアセンブラは、ショートシーケンスリードやノイズの多いロングリード用に開発されたもので、正確なロングリードには最適化されていない。ここでは、最近のデータの高い精度を利用した新しいメタゲノムアセンブラであるhifiasm-metaを紹介する。7つの経験的データセットで評価した結果，hifiasm-metaは，1つのデータセットにつき数十から数百の完全な環状の細菌ゲノムを再構築し，他のメタゲノムアセンブラよりも一貫して優れていた。 Hifiasm-metaはメタゲノムアセンブリのためのhifiasmの forkである… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F04%2F02%2F235642" title="メタゲノムのアセンブリを行う hifiasm-meta - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-04-02 23:56:42 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/04/02/235642 1.0 100%