kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ de novo transcriptome 2021 BMC Bioinformatics automated pipeline docker eukaryotic genome annotation 2021 9/1 論文追記 2022/12/27 追記 真核生物の遺伝子アノテーションは、蓄積された転写産物のデータを緻密に解析する必要があり、簡単な作業ではない。真核生物の遺伝子アノテーションには、重複する遺伝子を含むゲノムの転写活性領域、多数の転写産物を産生する遺伝子、トランスポサブルエレメント、多数の多様な配列反復などの課題がある。現在市販されている遺伝子アノテーションソフトウェアは、あらかじめ構築された完全長の遺伝子配列アセンブリに依存しており、エラーがないことは保証されていない。また、これらの配列の起源は不確かなことが多く、配列中のエラーを特定して修正することが困難である。そのため、… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F04%2F06%2F195441" title="自動化された真核生物の遺伝子アノテーションツール FINDER - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210406/20210406094429.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-04-06 19:54:41 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/04/06/195441 1.0 100%