kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2018 Microbial Genomics plasmid replicon type assembly コストパフォーマンスの高いIllumina社のショートリードシーケンシングにより、大規模な細菌集団遺伝学研究が日常的に行われるようになった。しかし、プラスミドのアセンブリが不完全であるため、プラスミドの含有量を分析することは依然として困難である。細菌の分離株にはいくつものプラスミドが含まれている可能性があるが、repetitive elementsが存在するため、アセンブリは複雑なままである。プラスミドを解析するためのツールは数多く開発されているが、ツールの性能や機能は様々である。MOB-suiteは、プラスミドの特性評価を容易にするために、ドラフトアセンブリデータからプラスミドを再構築し、タ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F04%2F14%2F094920" title="ドラフトアセンブリからプラスミドを同定する MOB-suite - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210414/20210414131741.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-04-14 09:49:20 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/04/14/094920 1.0 100%