kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 Preprint smORF 2021 4/21 追記 100コドン以下（300ヌクレオチド以下）の小さなオープンリーディングフレーム（smORF）のアノテーションは、ゲノム上にそのような配列が多数存在するため、困難を極める。しかし、近年の次世代シーケンスおよびリボソームプロファイリングの発展により、活発に翻訳されているsmORFを同定することが可能になった。本研究では、smORFを厳密に同定し、転写産物中の位置に応じて分類する計算機パイプラインを開発した。その結果、マウスのBおよびTリンパ球のデータセットから5744個のユニークなsmORFを同定し、ORFLineを用いてそれらを系統的に特徴づけることができた。さらに、s… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F04%2F18%2F062209" title="スモールオープンリーディングフレーム（smORF）を予測する ORFLine - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210418/20210418130348.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-04-18 06:22:09 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/04/18/062209 1.0 100%